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La materia orgánica proveniente de centros de faenamiento, puede aprovecharse mediante digestión anaerobia para producción de biogás y de un fertilizante rico en nutrientes. El monitoreo de la concentración de metano, propano y butano son parámetros relevantes que evidencian la eficiencia de digestión. En el presente estudio, se desarrolló una metodología para la medición de estos hidrocarburos, utilizando espectrofotometría infrarroja de transformadas de Fourier (FTIR) y la asistencia de cálculos químico-cuánticos, que permitieron la asignación de bandas de absorción de cada hidrocarburo en el biogás. Los límites de cuantificación fueron de 0,36 %V/V para propano y butano y 1,47 %V/V para metano. Se realizaron pruebas de biodigestión con desechos del centro de faenamiento municipal del Distrito Metropolitano de Quito, obteniéndose que una mezcla de rumen y estiércol bovino, sometida a 50 °C, generó biogás enriquecido hasta en un 65,4 %V/V de metano posterior a 15 días de biodigestión. Adicionalmente, se produjo digestado sólido y líquido que cumplen con las normativas internacionales para su posible aplicación en el suelo. Los resultados demostraron la potencialidad del método de seguimiento de biodigestión y la posible transformación de desechos de camal en una fuente de energía renovable.