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Este artículo presenta un análisis del enfoque estratégico y las capacidades de los centros de investigación del sector aeronáutico militar en Colombia. Para ello se utilizó una metodología descriptiva de revisión comparada.Se identificaron y analizaron seis centros de investigación en el sector, lo que permitió determinar su madurez en temas de ciencia y tecnología con base en sus capacidades y su estrategia, y cómo estas variables se relacionan con tres escenarios estratégicos del sector. Se destaca que los centros cuentan con capacidades para la producción de conocimiento; sin embargo, deben fortalecerse para lograr procesos de desarrollo tecnológico e innovación, aun cuando estos son objetivos de su estrategia. El avance en ciencia y tecnología del sector aeronáutico militar es fundamental para el cumplimiento de las políticas nacionales en defensa y seguridad.