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La gestión del bienestar de los peces de experimentación viene regulada en la legislación, pero su aplicación práctica requiere una traslación a la especie utilizada, así como a los requerimientos del experimento. Existen una serie de controles previos reflejados en los proyectos y procedimientos experimentales, así como una evaluación retrospectiva, todo encaminado a la revisión continuada y al refinamiento. Pero al final, en la gestión del bienestar están involucrados los investigadores, los cuidadores y el asesor de bienestar animal, que han de ser formados adecuadamente para las distintas técnicas. De esta manera se disminuye el impacto sobre el bienestar de los peces y se aumenta la significancia de las experiencias.