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El presente trabajo tiene el objetivo de obtener indicadores del proceso de estrés-recuperación basados en los cambios que provoca el entrenamiento intenso en la relación entre la variabilidad de la frecuencia cardiaca (VFC) y variables cognitivas. Para ello, se evaluó el estado de ánimo, los signos tempranos relacionados al síndrome de sobreentrenamiento y la VFC de los jugadores de la Selección Nacional Española de Hockey sobre Hierba. Los datos se recogieron durante el periodo de preparación Pre-Olímpica para Pekin 2008 en dos sesiones diferentes: (a) después de un periodo corto de descanso, y (b) después de un día de entrenamiento intenso. Los índices relacionados con la actividad parasimpática y con una elevada variabilidad de la frecuencia cardiaca correlacionaron negativamente con las puntuaciones del cuestionario estandarizado (CE) propuesta por la Sociedad Francesa de Medicina del Deporte (SFMS). Después del entrenamiento intenso, los parámetros de VFC relacionados con la actividad parasimpática decrecieron, a la vez que las puntuaciones de la subescala de fatiga del POMS incrementaron. Se propone un sistema de evaluación que, de manera simultánea, mida objetivamente -a través de la VFC- y subjetivamente -a través de cuestionarios- el proceso de estrés-recuperación de los jugadores de élite, a largo plazo -cuestionario CE; signos tempranos del síndrome de sobreentrenamiento o sobrecarga no funcional- y a corto plazo -cuestionario POMS; sobrecarga funcional-.