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Durante el siglo xix y las primeras décadas del xx, la investigación científica desarrollada en México giraba principalmente en torno al estudio de las plantas medicinales. Se analizan los instrumentos y técnicas utilizados durante este periodo por los farmacéuticos en sus labores de docencia e investigación. Su empleo estaba relacionado con la realización de análisis químicos de acuerdo con los procedimientos de las escuelas de farmacia europeas y se procuraba especialmente la búsqueda de alcaloides de utilidad terapéutica. Este interés de los farmacéuticos en el desarrollo de la enseñanza y la práctica del análisis químico fue fundamental y eventualmente permitió el establecimiento de la carrera de químico farmacéutico biólogo.