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O objetivo desse estudo foi comparar o número de espécies fitoplanctônicas (alfa diversidade) em períodos de chuva e seca de quatro lagos urbanos do município de Goiânia, bem como avaliar a riqueza total de espécies de cada lago (gama diversidade) e estimar essa riqueza usando extrapoladores de riqueza, e ainda investigar as mudanças nas composições fitoplanctônica entre os lagos (beta diversidade). Por fim, averiguar a influência das variáveis abióticas sobre os índices biológicos abordados. Durante o período de estudo um total de 325 espécies foram inventariadas. Os quatro lagos apresentaram características limnológicas distintas e apresentaram elevada riqueza de espécies: lago do Jardim Botânico (194 táxons), o lago do Parque Vaca Brava (171), Lago das Rosas (211) e o lago do Bosque dos Buritis (179). Observou-se baixa similaridade florística e elevada beta diversidade (β-1) variando de 42 (fevereiro de 2001) a 64 (outubro de 2001).