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Las microalgas oleaginosas constituyen una nueva alternativa para la producción de biodiesel, por su alta eficiencia fotobiosintética de triglicéridos y presentan productividades mayores de 10 a 100 veces que los cultivos convencionales. Además que actúan como sumideros de CO₂ y pueden usar aguas servidas para producir biodiesel. Sin embargo, los estudios sobre identificación de este tipo de microalgas en la amazonía son escasos. El objetivo del presente trabajo de investigación fue identificar especies de microalgas oleaginosas con potencial aplicación para la producción de biodiesel que se encuentran en ambientes acuáticos del Área de Concesión para Conservación de la Universidad Científica del Perú (UCP). La colecta de las muestras se realizó del 27/06/12 al 03/07/12 entre las 12 y 15 h utilizando red planctónica tipo cono y como preservante formol al 3%. La identificación microscópica se realizó en el Laboratorio de Ciencias Básicas de la UCP. La densidad de las microalgas fue realizada en base a su conteo en cámaras de Neubauer  y Sedgwick-Rafter. Los resultados muestran la presencia de 20 especies de microalgas, de las cuales cinco son microalgas oleaginosas. Correspondiente a las del género <em>Chlorella</em> quienes presentaron la mayor densidad promedio (6x10⁴ células/ml) en las tres cochas evaluadas.