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L'ingénierie écologique est un champ de l'ingénierie défini par rapport à une discipline scientifique, l'écologie. L'ingénieur écologue est-il « simplement » amené à appliquer les connaissances de l'écologie scientifique ? Comment envisager l'intégration entre la discipline scientifique et le travail d'ingénieur ? En nous restreignant au champ de la gestion des écosystèmes continentaux, nous insistons sur le fait que l'écologie scientifique ne peut pas prétendre être la seule source d'inspiration de l'ingénierie écologique, mais qu'elle a une place privilégiée pour vérifier la qualité de solutions proposées, par exemple à travers des suivis. Nous présentons par ailleurs le concept de gestion adaptative, promettant une intégration forte entre recherche écologique et gestion. Nous insistons sur les difficultés de mise en oeuvre de ce concept, tout en proposant de le tester sur quelques cas à définir.