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Une nouvelle technique de la biologie moléculaire, la réaction de polymérisation en chaine (PCR) permet l'identification des souches de levures de vinification. Mise en oeuvre directement sur levures entières, elle permet d'obtenir des profils variables selon les souches, par l'amplification de séquences d'ADN génomique. Utilisée sur lies, la PCR constitue un outil rapide et sensible pour le contrôle d'implantation des levains en vinification. Cependant le pouvoir discriminant de la PCR est inférieur à celui de l'électrophorèse en champ pulsé pour la caractérisation des souches de levures indigènes. Elle doit être considérée comme une technique complémentaire d'identification des souches de S. cerevisiae.