Characterising genome architectures using genome decomposition analysis par Eerik Aunin, Matthew Berriman, Adam James Reid

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Comparative study of transcriptome profiles of mechanical- and skin-transformed Schistosoma mansoni schistosomula. par Anna V Protasio, David W Dunne, Matthew Berriman

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The stage- and sex-specific transcriptome of the human parasite Schistosoma mansoni par Sarah K. Buddenborg, Zhigang Lu, Geetha Sankaranarayan, Stephen R. Doyle, Matthew Berriman

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International glossina genome initiative 2004-2014: a driver for post-genomic era research on the African continent. par Alan Christoffels, Dan Masiga, Matthew Berriman, Mike Lehane, Yeya Touré, Serap Aksoy

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Progression of the canonical reference malaria parasite genome from 2002–2019 [version 2; peer review: 3 approved] par Ulrike Böhme, Thomas D. Otto, Mandy Sanders, Chris I. Newbold, Matthew Berriman

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Progression of the canonical reference malaria parasite genome from 2002–2019 [version 1; peer review: 2 approved, 1 approved with reservations] par Ulrike Böhme, Thomas D. Otto, Mandy Sanders, Chris I. Newbold, Matthew Berriman

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RNAseq analysis of the parasitic nematode Strongyloides stercoralis reveals divergent regulation of canonical dauer pathways. par Jonathan D Stoltzfus, Samuel Minot, Matthew Berriman, Thomas J Nolan, James B Lok

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Identification of anti-schistosomal, anthelmintic and anti-parasitic compounds curated and text-mined from the scientific literature [version 1; peer review: 2 approved] par Noel M. O'Boyle, Gilda Padalino, Matthew Berriman, Karl F. Hoffmann, Avril Coghlan

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Dataset for a Dugesia japonica de novo transcriptome assembly, utilized for defining the voltage-gated like ion channel superfamily par John D. Chan, Dan Zhang, Xiaolong Liu, Magdalena Z. Zarowiecki, Matthew Berriman, Jonathan S. Marchant

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Using ChEMBL to Complement Schistosome Drug Discovery par Gilda Padalino, Avril Coghlan, Giampaolo Pagliuca, Josephine E. Forde-Thomas, Matthew Berriman, Karl F. Hoffmann

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Correction: A manually curated annotation characterises genomic features of P. falciparum lncRNAs par Johanna Hoshizaki, Sophie H. Adjalley, Vandana Thathy, Kim Judge, Matthew Berriman, Adam J. Reid, Marcus C. S. Lee

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A cell-surface phylome for African trypanosomes. par Andrew P Jackson, Harriet C Allison, J David Barry, Mark C Field, Christiane Hertz-Fowler, Matthew Berriman

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A manually curated annotation characterises genomic features of P. falciparum lncRNAs par Johanna Hoshizaki, Sophie H. Adjalley, Vandana Thathy, Kim Judge, Matthew Berriman, Adam J. Reid, Marcus C. S. Lee

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Systematic screening of 96 Schistosoma mansoni cell-surface and secreted antigens does not identify any strongly protective vaccine candidates in a mouse model of infection [versio... par Cecile Crosnier, Cordelia Brandt, Gabriel Rinaldi, Catherine McCarthy, Colin Barker, Simon Clare, Matthew Berriman, Gavin J. Wright

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Large CRISPR-Cas-induced deletions in the oxamniquine resistance locus of the human parasite Schistosoma mansoni [version 2; peer review: 4 approved] par Geetha Sankaranarayanan, Avril Coghlan, Patrick Driguez, Magda E. Lotkowska, Mandy Sanders, Nancy Holroyd, Alan Tracey, Matthew Berriman, Gabriel Rinaldi

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Refining the transcriptome of the human malaria parasite Plasmodium falciparum using amplification-free RNA-seq par Lia Chappell, Philipp Ross, Lindsey Orchard, Timothy J. Russell, Thomas D. Otto, Matthew Berriman, Julian C. Rayner, Manuel Llinás

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Global Gene Expression Profiling through the Complete Life Cycle of Trypanosoma vivax. par Andrew P Jackson, Sophie Goyard, Dong Xia, Bernardo J Foth, Mandy Sanders, Jonathan M Wastling, Paola Minoprio, Matthew Berriman

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Differences between Trypanosoma brucei gambiense groups 1 and 2 in their resistance to killing by trypanolytic factor 1. par Paul Capewell, Nicola J Veitch, C Michael R Turner, Jayne Raper, Matthew Berriman, Stephen L Hajduk, Annette MacLeod

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Genomic and Proteomic Studies on the Mode of Action of Oxaboroles against the African Trypanosome. par Deuan C Jones, Bernardo J Foth, Michael D Urbaniak, Stephen Patterson, Han B Ong, Matthew Berriman, Alan H Fairlamb

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Large CRISPR-Cas-induced deletions in the oxamniquine resistance locus of the human parasite Schistosoma mansoni [version 1; peer review: 2 approved] par Geetha Sankaranarayanan, Avril Coghlan, Patrick Driguez, Magda E. Lotkowska, Mandy Sanders, Nancy Holroyd, Alan Tracey, Matthew Berriman, Gabriel Rinaldi

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