Výsledky vyhledávání - Daniel C. Zielinski

  • Zobrazuji výsledky 1 - 14 z 14
Upřesnit hledání
  1. 1
    Modeling genome-wide enzyme evolution predicts strong epistasis underlying catalytic turnover rates

    Modeling genome-wide enzyme evolution predicts strong epistasis underlying catalytic turnover rates Autor David Heckmann, Daniel C. Zielinski, Bernhard O. Palsson

    Vydáno 2018-12-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  2. 2
    Topological and kinetic determinants of the modal matrices of dynamic models of metabolism.

    Topological and kinetic determinants of the modal matrices of dynamic models of metabolism. Autor Bin Du, Daniel C Zielinski, Bernhard O Palsson

    Vydáno 2017-01-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  3. 3
    The quantitative metabolome is shaped by abiotic constraints

    The quantitative metabolome is shaped by abiotic constraints Autor Amir Akbari, James T. Yurkovich, Daniel C. Zielinski, Bernhard O. Palsson

    Vydáno 2021-05-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  4. 4
    Differential Expression Analysis Utilizing Condition-Specific Metabolic Pathways

    Differential Expression Analysis Utilizing Condition-Specific Metabolic Pathways Autor Gianluca Mattei, Zhuohui Gan, Matteo Ramazzotti, Bernhard O. Palsson, Daniel C. Zielinski

    Vydáno 2023-11-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  5. 5
    MASSpy: Building, simulating, and visualizing dynamic biological models in Python using mass action kinetics.

    MASSpy: Building, simulating, and visualizing dynamic biological models in Python using mass action kinetics. Autor Zachary B Haiman, Daniel C Zielinski, Yuko Koike, James T Yurkovich, Bernhard O Palsson

    Vydáno 2021-01-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  6. 6
    The hallmarks of a tradeoff in transcriptomes that balances stress and growth functions

    The hallmarks of a tradeoff in transcriptomes that balances stress and growth functions Autor Christopher Dalldorf, Kevin Rychel, Richard Szubin, Ying Hefner, Arjun Patel, Daniel C. Zielinski, Bernhard O. Palsson

    Vydáno 2024-07-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  7. 7
    Empowering drug off-target discovery with metabolic and structural analysis

    Empowering drug off-target discovery with metabolic and structural analysis Autor Sourav Chowdhury, Daniel C. Zielinski, Christopher Dalldorf, Joao V. Rodrigues, Bernhard O. Palsson, Eugene I. Shakhnovich

    Vydáno 2023-06-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  8. 8
    A systems approach to predict oncometabolites via context-specific genome-scale metabolic networks.

    A systems approach to predict oncometabolites via context-specific genome-scale metabolic networks. Autor Hojung Nam, Miguel Campodonico, Aarash Bordbar, Daniel R Hyduke, Sangwoo Kim, Daniel C Zielinski, Bernhard O Palsson

    Vydáno 2014-09-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  9. 9
    Inferred regulons are consistent with regulator binding sequences in E. coli.

    Inferred regulons are consistent with regulator binding sequences in E. coli. Autor Sizhe Qiu, Xinlong Wan, Yueshan Liang, Cameron R Lamoureux, Amir Akbari, Bernhard O Palsson, Daniel C Zielinski

    Vydáno 2024-01-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  10. 10
    Bottom-up parameterization of enzyme rate constants: Reconciling inconsistent data

    Bottom-up parameterization of enzyme rate constants: Reconciling inconsistent data Autor Daniel C. Zielinski, Marta R.A. Matos, James E. de Bree, Kevin Glass, Nikolaus Sonnenschein, Bernhard O. Palsson

    Vydáno 2024-06-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  11. 11
    Machine learning applied to enzyme turnover numbers reveals protein structural correlates and improves metabolic models

    Machine learning applied to enzyme turnover numbers reveals protein structural correlates and improves metabolic models Autor David Heckmann, Colton J. Lloyd, Nathan Mih, Yuanchi Ha, Daniel C. Zielinski, Zachary B. Haiman, Abdelmoneim Amer Desouki, Martin J. Lercher, Bernhard O. Palsson

    Vydáno 2018-12-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  12. 12
    Reconstructing the transcriptional regulatory network of probiotic L. reuteri is enabled by transcriptomics and machine learning

    Reconstructing the transcriptional regulatory network of probiotic L. reuteri is enabled by transcriptomics and machine learning Autor Jonathan Josephs-Spaulding, Akanksha Rajput, Ying Hefner, Richard Szubin, Archana Balasubramanian, Gaoyuan Li, Daniel C. Zielinski, Leonie Jahn, Morten Sommer, Patrick Phaneuf, Bernhard O. Palsson

    Vydáno 2024-03-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  13. 13
    A genome-scale metabolic model of a globally disseminated hyperinvasive M1 strain of Streptococcus pyogenes

    A genome-scale metabolic model of a globally disseminated hyperinvasive M1 strain of Streptococcus pyogenes Autor Yujiro Hirose, Daniel C. Zielinski, Saugat Poudel, Kevin Rychel, Jonathon L. Baker, Yoshihiro Toya, Masaya Yamaguchi, Almut Heinken, Ines Thiele, Shigetada Kawabata, Bernhard O. Palsson, Victor Nizet

    Vydáno 2024-09-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:
  14. 14
    Elucidation of independently modulated genes in Streptococcus pyogenes reveals carbon sources that control its expression of hemolytic toxins

    Elucidation of independently modulated genes in Streptococcus pyogenes reveals carbon sources that control its expression of hemolytic toxins Autor Yujiro Hirose, Saugat Poudel, Anand V. Sastry, Kevin Rychel, Cameron R. Lamoureux, Richard Szubin, Daniel C. Zielinski, Hyun Gyu Lim, Nitasha D. Menon, Helena Bergsten, Satoshi Uchiyama, Tomoki Hanada, Shigetada Kawabata, Bernhard O. Palsson, Victor Nizet

    Vydáno 2023-06-01
    Získat plný text
    Článek
    Přidat do oblíbených
    Uloženo v:

Vyhledávací nástroje: